Powtarzające się mutacje wykrywane przez sekwencjonowanie genomu ostrej białaczki szpikowej ad 5

Pozostałe dziewięć mutacji nie wykryto w 187 dodatkowych próbkach. Nie wykryliśmy mutacji R172 w IDH2 w 188 próbkach (próba od pacjenta wskaźnikowego i 187 dodatkowych próbek), ani nie zaobserwowaliśmy dodatkowych mutacji w żadnym z eksonów IDH1 lub CDC42. Niesynonimiczna nabyta mutacja (C328Y) została znaleziona w mitochondrialnym genie ND4, który koduje podjednostkę 4 dehydrogenazy NADH, część kompleksu łańcucha transportu elektronów. Dwa z 93 dodatkowych próbek AML również zawierały niesynonimowe mutacje w tym genie, ale znaczenie tych mutacji nie jest jeszcze jasne (Tabela 5 oraz sekcja Wyniki i dyskusja w dodatkowym dodatku).
Mutacje poziomu 2
Potwierdziliśmy 52 mutacje w segmentach DNA poziomu 2, z których każdy zawiera z 52 mutacji, amplifikowano PCR z guza i próbek skóry i zsekwencjonowano w celu określenia proporcji cząsteczek DNA niosących mutację (Figura 2B i Tabela 4 w Dodatek dodatkowy). Read more „Powtarzające się mutacje wykrywane przez sekwencjonowanie genomu ostrej białaczki szpikowej ad 5”

Powtarzające się mutacje wykrywane przez sekwencjonowanie genomu ostrej białaczki szpikowej czesc 4

Częstość alleli w DNA guza, DNA komplementarny dla nowotworu i DNA skóry. Panel A pokazuje procent wariantów alleli, które wykryto w DNA nowotworu, DNA uzupełniającym nowotwór (cDNA) i DNA skóry dla 10 zwalidowanych niesynonimowych mutacji somatycznych poziomu u pacjenta z indeksem. Dla porównania pokazano warianty częstości alleli dla sześciu znanych polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP). Pacjent był homozygotyczny dla sekwencji referencyjnej dla dwóch pierwszych wariantów, heterozygotycznej dla dwóch kolejnych wariantów i homozygotycznej dla rzadkiego SNP dla dwóch ostatnich wariantów. Panel B pokazuje warianty alleli wariantów dla wszystkich zwalidowanych mutacji poziomu i poziomu 2 oraz sześciu kontrolnych SNP dla DNA nowotworu i DNA skóry. Read more „Powtarzające się mutacje wykrywane przez sekwencjonowanie genomu ostrej białaczki szpikowej czesc 4”

Powtarzające się mutacje wykrywane przez sekwencjonowanie genomu ostrej białaczki szpikowej cd

Maq oznacza mapowanie i złożenie z jakością, polimorfizm pojedynczego nukleotydu SNP i wariant pojedynczego nukleotydu SNV. Podsumowanie różnic sekwencji między genomem nowotworu pacjenta a Narodowym Centrum Informacji o Biotechnologii 36 genomu referencyjnego pokazano na Rysunku (patrz Glosariusz) .20 Zidentyfikowaliśmy 3 872 936 SNV w genomie nowotworu, z czego 3 464 449 rygorystyczny filtr wywoływania. Spośród tych SNV w genomie skóry wykryto 3 377 680 (97,5%), co wskazuje, że były to odziedziczone warianty. Spośród 86 769 potencjalnie nowych syste- mów SNV w szóstym roku, 66 513 zostało opisanych wcześniej.
Oddzieliliśmy pozostałe 20 256 SNV na cztery poziomy, które zostały szczegółowo opisane w dodatkowym dodatku. Read more „Powtarzające się mutacje wykrywane przez sekwencjonowanie genomu ostrej białaczki szpikowej cd”

Powtarzające się mutacje wykrywane przez sekwencjonowanie genomu ostrej białaczki szpikowej ad

Wszystkie wysokiej jakości warianty pojedynczych nukleotydów (SNV), które znaleziono w próbkach nowotworu i skóry od tego pacjenta, są dostępne w bazie danych genotypów i fenotypów (dbGaP) w Narodowym Centrum Informacji o Biotechnologii (numer dostępu, phs000159.v1. p1). Wyniki
Opis przypadku
Wcześniej zdrowy 38-letni mężczyzna o europejskim pochodzeniu miał zmęczenie i kaszel. Liczba białych krwinek wynosiła 39 800 komórek na milimetr sześcienny, przy 97% wybuchach; poziom hemoglobiny wynosił 8,9 g na decylitr, a liczba płytek krwi wynosiła 35 000 na milimetr sześcienny. Badanie szpiku kostnego wykazało 90-procentową komórkowość i 86% dodatnich blaszek mieloperoksydazy (Figura w dodatkowym dodatku). Read more „Powtarzające się mutacje wykrywane przez sekwencjonowanie genomu ostrej białaczki szpikowej ad”

Powtarzające się mutacje wykrywane przez sekwencjonowanie genomu ostrej białaczki szpikowej

Pełny zestaw mutacji DNA, które są odpowiedzialne za patogenezę ostrej białaczki szpikowej (AML), nie jest jeszcze znany. Metody
Wykorzystaliśmy masowo równoległe sekwencjonowanie DNA w celu uzyskania bardzo wysokiego poziomu pokrycia (około 98%) pierwotnego, cytogenetycznie prawidłowego genomu de novo dla AML z minimalnym dojrzewaniem (AML-M1) i dopasowanym genomem prawidłowej skóry.
Wyniki
Zidentyfikowaliśmy 12 nabytych (somatycznych) mutacji w obrębie sekwencji kodujących genów i 52 punktowe mutacje somatyczne w konserwatywnych lub regulacyjnych częściach genomu. Wszystkie mutacje okazały się heterozygotyczne i obecne w prawie wszystkich komórkach w próbce nowotworu. Cztery z 64 mutacji wystąpiły w co najmniej dodatkowej próbce AML w 188 testowanych próbkach. Read more „Powtarzające się mutacje wykrywane przez sekwencjonowanie genomu ostrej białaczki szpikowej”

Budowanie mostu od fragmentacji do odpowiedzialności – model płatności Prometheus czesc 4

Elektrokardiogram ujawnia uniesienie odcinka ST w bocznych odprowadzeniach. Mężczyzna zostaje przewieziony do laboratorium cewnikowania serca, w którym angiografia wieńcowa ujawnia ciężką postać choroby potrójnej, a także 60% zwężenie lewej głównej tętnicy wieńcowej. Lewy ventriculogram pokazuje niedomykalność mitralną (stopień 2 do 3) z dysfunkcją mięśni brodawkowatych. Pacjent jest następnie zabierany pilnie na salę operacyjną, gdzie otrzymuje dwa żylne przeszczepy i lewy-wewnętrzny tętniak-klatkę piersiową. Ponadto wykonuje się procedurę rekonstrukcji zastawki mitralnej w celu skorygowania niedomykalności mitralnej. Read more „Budowanie mostu od fragmentacji do odpowiedzialności – model płatności Prometheus czesc 4”

Budowanie mostu od fragmentacji do odpowiedzialności – model płatności Prometheus cd

Ograniczeniem wielu programów płatności odcinkowych jest ich zależność od przyszłych płatności, co zmusza płatnika do znalezienia organizacji, które zaakceptują opłatę globalną. Natomiast model Prometheus można wdrożyć w rozdrobniony, w dużej mierze oparty na opłatach system dostarczania usług, jeśli płatnik zachowuje rolę integratora finansowego. Z biegiem czasu, jako że dostawcy współpracują w celu poprawy opieki nad pacjentem i optymalizacji swoich marż, mogą bardziej formalnie zintegrować się z odpowiedzialnymi organizacjami. Jednak będzie to i powinien być ich wybór, aby to zrobić. Aby ułatwić to przejście, obecne strony pilotażowe Prometheus nie korzystają z przyszłych płatności. Read more „Budowanie mostu od fragmentacji do odpowiedzialności – model płatności Prometheus cd”

Budowanie mostu od fragmentacji do odpowiedzialności – model płatności Prometheus ad

Dane pochodzą z Ministerstwa Zdrowia i Opieki Społecznej 2009 oraz naszej własnej analizy. PAC oznacza potencjalnie możliwy do uniknięcia koszt. Możliwości poprawy jakości przy jednoczesnym obniżeniu kosztów są znaczne, wykraczając daleko poza dobrze nagłośniony problem możliwych do uniknięcia readmisji. Nasze analizy kilku krajowych i regionalnych zestawów danych, oprócz naszej pracy pilotażowej, pokazują, że publicznie dostępne komputery stanowią 22% wszystkich wydatków na służbę zdrowia w sektorze prywatnym w Stanach Zjednoczonych. 4,5 Dane pokazują, że publicznie dostępne komputery mogą odpowiadać za jako 80% wszystkich dolarów wydanych na warunki, takie jak zastoinowa niewydolność serca, które wymagają intensywnego zarządzania, oraz że istnieją znaczne regionalne różnice w PAC. Read more „Budowanie mostu od fragmentacji do odpowiedzialności – model płatności Prometheus ad”

Budowanie mostu od fragmentacji do odpowiedzialności – model płatności Prometheus

W obecnej debacie na temat reformy systemu opieki zdrowotnej wielu obserwatorów proponuje nowe struktury dostarczania, aby przenieść amerykańską służbę zdrowia z rozdrobnienia, słabych wyników i dysfunkcji w kierunku odpowiedzialności za opiekę o wysokiej wartości. Idealnie byłoby, gdyby te nowe struktury promowały wyraźną odpowiedzialność za poprawę jakości i kontrolowanie kosztów, a także zachęcałyby pracowników służby zdrowia do organizowania się w zespoły pracujące w imieniu pacjentów. Aby jednak takie struktury były trwałe, system płatności musi nagradzać profesjonalistów za jakość i wydajność usług, a nie za ilość. Nasze systemy płatności za usługi przyczyniły się, jeśli nie w dużej mierze, do obecnego rozdrobnienia. Płatności za usługę stanowią zachętę do zapewniania wysokiego wolumenu, a nie wysokiej wartości – więcej, nie lepiej, opieki. Read more „Budowanie mostu od fragmentacji do odpowiedzialności – model płatności Prometheus”

Postępująca wieloogniskowa leukoencefalopatia po monoterapii natalizumabem ad 5

Potrzebna jest czujność kliniczna w przypadku objawów sugerujących PML, które w pewnym stopniu pokrywają się z objawami stwardnienia rozsianego. Liberalne wykorzystanie MRI jest zalecane do wykrywania zmian typowych dla PML, ale zróżnicowanie zmian PML w porównaniu ze zmianami związanymi ze stwardnieniem rozsianym może być trudne, co ilustrują wyniki u naszego pacjenta, który początkowo miał tylko pojedyncze uszkodzenie w badaniu MRI. , w przeciwieństwie do typowej wieloogniskowej prezentacji PML. Rozpoznanie można ustalić poprzez wykrycie wirusa JC w płynie mózgowo-rdzeniowym, stwierdzenie, które ma swoistość prawie 100%, ale czułość w zakresie od 60 do 80%, w zależności od konkretnego laboratorium analizującego próbkę i być może na temat zmian w spektrum zakażeń PML.20,21 Przypadek, który opisujemy, podkreśla, że jeśli przebieg kliniczny i wyniki MRI nadal sugerują PML, pomimo braku wykrywalnego DNA wirusa JC w płynie mózgowo-rdzeniowym, należy nadal monitorować pacjenta dla PML. Jako kolejną komplikację, próbki płynu mózgowo-rdzeniowego w rzadkich przypadkach były pozytywne dla wirusa JC przy braku PML, chociaż przy bardzo niskiej liczbie kopii.19 Ostateczna diagnoza może być również ustalona za pomocą biopsji mózgu, która nie została wykonana w naszego pacjenta z powodu lokalizacji zmiany w korze ruchowej. Read more „Postępująca wieloogniskowa leukoencefalopatia po monoterapii natalizumabem ad 5”